Relatório Carga Fapesp / 2012Emissão: 08/01/2015 21:03:00

DTC - DEPARTAMENTO DE TEORIA DA COMPUTACAO

Projeto Alterado
Nome Projeto: PROBLEMAS DE DISTANCIAS DE REARRANJOS DE GENOMAS
Tipo Projeto: Pesquisa Básica
Situação Projeto: Em Andamento
Data Início Projeto: 07/2012
Ano Fim Projeto: 2014
Tipo Envolvimento Contrato: Individual
Descrição Projeto
Um modo de comparar dois genomas é computar uma distância entre eles. Idealmente, essa distância deve refletir as divergências evolucionárias entre ambos. Os fenômenos responsáveis pelas diferenciações entre os seres-vivos são as mutações ocorridas no material genético. Os eventos de mutação mais comuns afetam pontualmente o genoma, inserindo, removendo ou substituindo nucleotídeos. Entretanto, eventos de mutações globais, os chamados rearranjos de genomas, afetam grandes trechos do genoma e são um desafio para a teoria da computação, pois, na maioria dos casos, computar uma distância entre genomas na presença de operações globais resulta em problemas NP-Completos. Este projeto de pesquisa foca em heurísticas, algoritmos e provas formais para problemas NP-Completos ou com complexidade indefinida em rearranjo de genomas. Alguns tópicos de pesquisa serão específicos para certas classes de operações como, por exemplo, reversões ou transposições.
Linha Pesquisa:
Bioinformática e Biologia Computacional
Instituições
Nome:
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
Tipo do Financiamento: Bolsa Pos doutorado no país PD
Nº Processo na Financiadora: 2012/01584-3
Data Início Financiamento: 07/2012
Data Fim Financiamento: 06/2015
Valor do Financiamento: R$ 252.827,03
Complemento do Tipo Financiamento: BOLSA NO PAIS-PD
Órgãos
(IC) DTC - DEPARTAMENTO DE TEORIA DA COMPUTACAO [34.12.00.00.00.00.00]
Equipes Projeto
Ulisses Martins Dias( Participante )
ZANONI DIAS( Responsável )

Projeto Alterado
Nome Projeto: MODELO ALGEBRICO DE REARRANJO DE GENOMAS
Tipo Projeto: Pesquisa Básica
Situação Projeto: Concluído
Data Início Projeto: 10/2012
Ano Fim Projeto: 2013
Tipo Envolvimento Contrato: Individual
Descrição Projeto: MODELO ALGEBRICO DE REARRANJO DE GENOMAS
Linha Pesquisa:
Bioinformática e Biologia Computacional
Instituições
Nome:
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
Tipo do Financiamento: Bolsa Doutorado DR
Nº Processo na Financiadora: 2012/13865-7
Data Início Financiamento: 10/2012
Data Fim Financiamento: 03/2016
Valor do Financiamento: R$ 111.753,43
Complemento do Tipo Financiamento: BOLSA NO PAIS-DR-II
Órgãos
(IC) DTC - DEPARTAMENTO DE TEORIA DA COMPUTACAO [34.12.00.00.00.00.00]
Equipes Projeto
João Paulo Pereira Zanetti( Participante )
JOAO MEIDANIS( Responsável )

Projeto Alterado
Nome Projeto: ESTRUTURA DE DADOS GEMA PARA TRIANGULACAO DE MAPAS TOPOLOGICOS N-DIMENSIONAIS.
Tipo Projeto: Pesquisa Básica
Situação Projeto: Em Andamento
Data Início Projeto: 11/2012
Ano Fim Projeto: 2014
Tipo Envolvimento Contrato: Individual
Descrição Projeto: ESTRUTURA DE DADOS GEMA PARA TRIANGULACAO DE MAPAS TOPOLOGICOS N-DIMENSIONAIS.
Linha Pesquisa:
Algoritmos e Otimização
Instituições
Nome:
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
Tipo do Financiamento: Bolsa Doutorado DR
Nº Processo na Financiadora: 2012/14698-7
Data Início Financiamento: 11/2012
Data Fim Financiamento: 07/2015
Valor do Financiamento: R$ 130.301,98
Complemento do Tipo Financiamento: BOLSA NO PAIS-DR-II
Órgãos
(IC) DTC - DEPARTAMENTO DE TEORIA DA COMPUTACAO [34.12.00.00.00.00.00]
Equipes Projeto
Lucas Moutinho Bueno( Participante )
JORGE STOLFI( Responsável )



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